Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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C9orf85Q96MD7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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C9orf85Q96MD7 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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C9orf85Q96MD7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
C9orf85Q96MD7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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