Protein–RNA interactions for Protein: Q93063

EXT2, Exostosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT2Q93063 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EXT2Q93063 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EXT2Q93063 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms