Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
PMCHL1Q16048 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms