Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EMX2Q04743 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms