Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 42.2
TBRG4Q969Z0 RANGAP1-205ENST00000446258 759 ntTSL 313.05□□□□□ -0.321e-6■■■■■ 42.2
TBRG4Q969Z0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.89e-7■■■■■ 42.2
TBRG4Q969Z0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.669e-7■■■■■ 42.2
TBRG4Q969Z0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.669e-7■■■■■ 42.2
TBRG4Q969Z0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.369e-7■■■■■ 42.2
TBRG4Q969Z0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 42.2
TBRG4Q969Z0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.219e-7■■■■■ 42.2
TBRG4Q969Z0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.159e-7■■■■■ 42.2
TBRG4Q969Z0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 42.2
TBRG4Q969Z0 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.077e-7■■■■■ 42.2
TBRG4Q969Z0 ATP6V0E2-206ENST00000471877 1766 ntTSL 214.31□□□□□ -0.129e-7■■■■■ 42.2
TBRG4Q969Z0 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.169e-7■■■■■ 42.2
TBRG4Q969Z0 NPC1-202ENST00000540608 2790 ntTSL 212.3□□□□□ -0.447e-7■■■■■ 42.2
TBRG4Q969Z0 CAPRIN1-212ENST00000532820 3438 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.293e-7■■■■■ 42.1
TBRG4Q969Z0 CAPRIN1-201ENST00000341394 4108 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.743e-7■■■■■ 42.1
TBRG4Q969Z0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.751e-6■■■■■ 42
TBRG4Q969Z0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.282e-6■■■■■ 41.9
TBRG4Q969Z0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 41.9
TBRG4Q969Z0 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.982e-6■■■■■ 41.9
TBRG4Q969Z0 SRPK1-210ENST00000508473 858 ntTSL 223.6■■□□□ 1.372e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 FAM208B-205ENST00000473789 506 ntTSL 523.36■■□□□ 1.332e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 FAM208B-210ENST00000496681 522 ntTSL 322.84■■□□□ 1.252e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 CDC42SE2-207ENST00000504701 567 ntTSL 421.9■■□□□ 1.12e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 WNK2-206ENST00000448039 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)21.31■■□□□ 15e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.885e-13■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.865e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.832e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.775e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.645e-13■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 FAM208B-207ENST00000480839 540 ntTSL 318.74■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.52e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 COQ8A-209ENST00000489044 941 ntTSL 318.12■□□□□ 0.494e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.475e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.415e-13■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 TNIP1-207ENST00000520695 658 ntTSL 417.61■□□□□ 0.415e-13■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.45e-13■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.374e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 NUMA1-213ENST00000537217 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)17.32■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.355e-13■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 WNK2-205ENST00000432730 7792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)17.24■□□□□ 0.355e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.295e-13■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.264e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 FAM208B-206ENST00000477043 514 ntTSL 216.53■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.212e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.195e-13■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 PSMA6-212ENST00000556167 601 ntTSL 216.14■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.092e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 SPG7-204ENST00000561911 1025 ntTSL 515.58■□□□□ 0.085e-13■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.024e-6■■■■■ 41.8
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TBRG4Q969Z0 CDC42SE2-209ENST00000506419 458 ntTSL 313.9□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 41.8
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TBRG4Q969Z0 TNIP1-201ENST00000315050 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.395e-13■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 TNIP1-218ENST00000523338 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.445e-13■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 TNIP1-213ENST00000522100 877 ntTSL 312.12□□□□□ -0.475e-13■■■■■ 41.8
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TBRG4Q969Z0 NUMA1-218ENST00000540843 1969 ntTSL 212.08□□□□□ -0.482e-6■■■■■ 41.8
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TBRG4Q969Z0 NUMA1-212ENST00000536119 1686 ntTSL 211.15□□□□□ -0.622e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 RPRD1B-201ENST00000373433 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.647e-7■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 NUMA1-207ENST00000534987 2211 ntTSL 210.61□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 FRAS1-201ENST00000325942 7142 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.742e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 PSMA6-211ENST00000555764 1002 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.792e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 TNIP1-209ENST00000521001 575 ntTSL 49.77□□□□□ -0.855e-13■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 SRPK1-209ENST00000507909 581 ntTSL 49.72□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 AL137230.2-201ENST00000555070 452 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.973e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC8.46□□□□□ -1.052e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 CDC42SE2-208ENST00000505065 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.112e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 PSMA6-202ENST00000540871 912 ntTSL 2 BASIC8.08□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 PSMA6-203ENST00000553688 787 ntTSL 57.86□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 PSMA6-209ENST00000554961 814 ntTSL 27.86□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 PSMA6-207ENST00000554620 790 ntTSL 57.86□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 LRBA-207ENST00000509835 5578 ntTSL 1 (best)7.2□□□□□ -1.262e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 PSMA6-204ENST00000553809 879 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.312e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.312e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.372e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 SRPK1-212ENST00000512445 559 ntTSL 56.44□□□□□ -1.382e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.482e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 SRPK1-213ENST00000513367 634 ntTSL 25.77□□□□□ -1.492e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.492e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 SESTD1-206ENST00000446758 1699 ntTSL 24.6□□□□□ -1.676e-7■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.681e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 CDC42SE2-211ENST00000511432 286 ntTSL 53.25□□□□□ -1.892e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 CDC42SE2-205ENST00000502840 539 ntTSL 42.97□□□□□ -1.932e-6■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 MAP4K3-203ENST00000414968 558 ntTSL 41.78□□□□□ -2.127e-7■■■■■ 41.8
TBRG4Q969Z0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 41.8
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