Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZNHIT3Q15649 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZNHIT3Q15649 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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