Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.61e-6■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.561e-6■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.291e-6■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.121e-6■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 LGALS3BP-206ENST00000587310 768 ntTSL 218.3■□□□□ 0.528e-10■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 LGALS3BP-215ENST00000589775 893 ntTSL 317.43■□□□□ 0.388e-10■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.188e-10■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 LGALS3BP-211ENST00000588587 1020 ntTSL 515.08■□□□□ 08e-10■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 LGALS3BP-216ENST00000589906 540 ntTSL 314.84□□□□□ -0.038e-10■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 ATP2A2-211ENST00000552636 529 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.152e-7■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.199e-7■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 LGR5-202ENST00000536515 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.289e-7■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 LGR5-206ENST00000550851 4095 ntTSL 211.94□□□□□ -0.59e-7■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 LGR5-203ENST00000540815 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.529e-7■■□□□ 12.5
PCBP1Q15365 ERBB3-219ENST00000551242 2755 ntTSL 1 (best)11.74□□□□□ -0.539e-31■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 ERBB3-201ENST00000267101 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.569e-31■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 ERBB3-214ENST00000550070 2729 ntTSL 1 (best)10.31□□□□□ -0.769e-31■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 ERBB3-203ENST00000415288 4353 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.919e-31■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 ERBB3-213ENST00000549832 3289 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.099e-31■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 ERBB3-221ENST00000553131 3237 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.159e-31■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.499e-31■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 SUPT5H-216ENST00000599335 3796 ntTSL 211.35□□□□□ -0.591e-6■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.041e-7■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.761e-7■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.22e-6■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 UROD-219ENST00000494399 1848 ntTSL 214.88□□□□□ -0.032e-6■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 UROD-221ENST00000636293 1102 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.362e-6■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 UROD-222ENST00000636836 1173 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.372e-6■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.184e-8■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.654e-8■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 CBFA2T3-205ENST00000563856 2380 ntTSL 218.16■□□□□ 0.54e-8■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.424e-8■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.294e-8■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 EIF3B-210ENST00000468611 1868 ntTSL 216.56■□□□□ 0.244e-8■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.154e-8■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.134e-8■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 EIF3B-207ENST00000465670 2766 ntTSL 214.28□□□□□ -0.124e-8■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 BSDC1-209ENST00000526031 1361 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.194e-8■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 EIF3B-211ENST00000475415 3745 ntTSL 210.49□□□□□ -0.734e-8■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 DNM1-226ENST00000637317 100 ntTSL 54.34□□□□□ -1.714e-8■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.041e-8■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.071e-8■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.291e-8■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 PLXNB1-203ENST00000449094 3863 ntTSL 212.71□□□□□ -0.381e-8■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.063e-6■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 EFNA1-201ENST00000368406 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.193e-6■■□□□ 12.4
PCBP1Q15365 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.355e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 ATP1A1-211ENST00000537345 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.545e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 ATP1A1-205ENST00000440951 579 ntTSL 57.87□□□□□ -1.155e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.335e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.076e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 RRBP1-202ENST00000360807 3727 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.246e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.266e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.366e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.496e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 RRBP1-210ENST00000610403 3309 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.526e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 COPZ1-201ENST00000262061 1897 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.572e-6■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 LGALS3BP-214ENST00000589527 818 ntTSL 315.83■□□□□ 0.126e-10■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.181e-12■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.051e-12■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 MLXIP-209ENST00000539861 1384 ntTSL 1 (best)13.71□□□□□ -0.223e-10■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 MLXIP-207ENST00000538061 1078 ntTSL 39.29□□□□□ -0.923e-10■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 MLXIP-203ENST00000377037 805 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.193e-10■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 NFATC3-209ENST00000561714 792 ntTSL 325.14■■□□□ 1.623e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 NFATC3-210ENST00000562171 707 ntTSL 323.34■■□□□ 1.333e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 NFATC3-219ENST00000568466 737 ntTSL 223.08■■□□□ 1.293e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 NFATC3-206ENST00000539828 2484 ntTSL 217.44■□□□□ 0.383e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.243e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.073e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 NFATC3-217ENST00000566893 715 ntTSL 213.52□□□□□ -0.253e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 NFATC3-213ENST00000563319 4122 ntTSL 1 (best)10.45□□□□□ -0.743e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 NFATC3-204ENST00000379165 3583 ntTSL 29.79□□□□□ -0.843e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 NFATC3-208ENST00000553077 3870 ntTSL 29.77□□□□□ -0.853e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 NFATC3-220ENST00000569766 3555 ntTSL 1 (best)8.32□□□□□ -1.083e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.193e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 NFATC3-207ENST00000549350 3588 ntTSL 27.38□□□□□ -1.233e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.313e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 NFATC3-216ENST00000566301 3840 ntTSL 1 (best)6.62□□□□□ -1.353e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 NFATC3-221ENST00000570212 3181 ntTSL 1 (best)6.54□□□□□ -1.363e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 NFATC3-212ENST00000563288 3790 ntTSL 1 (best)6.51□□□□□ -1.373e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 NFATC3-211ENST00000562926 3748 ntTSL 1 (best)6.5□□□□□ -1.373e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 NFATC3-205ENST00000535127 4194 ntTSL 1 (best)6.42□□□□□ -1.383e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 NFATC3-218ENST00000567152 3186 ntTSL 1 (best)5.56□□□□□ -1.523e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 NFATC3-214ENST00000563796 3753 ntTSL 1 (best)4.79□□□□□ -1.643e-7■■□□□ 12.3
PCBP1Q15365 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.973e-6■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.813e-6■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.653e-6■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.443e-6■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 RELA-220ENST00000532999 1341 ntTSL 515.94■□□□□ 0.143e-6■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 RELA-208ENST00000526283 2004 ntTSL 514.89□□□□□ -0.033e-6■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 RELA-205ENST00000525693 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.583e-6■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 RELA-217ENST00000531484 2251 ntTSL 210.69□□□□□ -0.73e-6■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 PABPC1-202ENST00000517403 560 ntTSL 59.5□□□□□ -0.891e-30■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 PABPC1-207ENST00000518716 694 ntTSL 26.68□□□□□ -1.341e-30■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 PABPC1-212ENST00000519622 667 ntTSL 54.63□□□□□ -1.671e-30■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 PABPC1-211ENST00000519596 771 ntTSL 33.22□□□□□ -1.891e-30■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 GUK1-234ENST00000492871 1065 ntTSL 328.79■■■□□ 2.22e-6■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 GUK1-235ENST00000493138 694 ntTSL 327.88■■■□□ 2.052e-6■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.882e-6■■□□□ 12.2
PCBP1Q15365 GUK1-220ENST00000471270 657 ntTSL 224.99■■□□□ 1.592e-6■■□□□ 12.2
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