Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCN1BQ07699 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms