Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGCP20142 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGCP20142 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PGCP20142 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGCP20142 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGCP20142 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGCP20142 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGCP20142 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGCP20142 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGCP20142 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGCP20142 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PGCP20142 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGCP20142 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGCP20142 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGCP20142 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGCP20142 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGCP20142 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PGCP20142 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PGCP20142 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PGCP20142 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PGCP20142 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms