Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PGCP20142 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PGCP20142 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
PGCP20142 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PGCP20142 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PGCP20142 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PGCP20142 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PGCP20142 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PGCP20142 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PGCP20142 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PGCP20142 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PGCP20142 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PGCP20142 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PGCP20142 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PGCP20142 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PGCP20142 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PGCP20142 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PGCP20142 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PGCP20142 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PGCP20142 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PGCP20142 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PGCP20142 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PGCP20142 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PGCP20142 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PGCP20142 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PGCP20142 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PGCP20142 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PGCP20142 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PGCP20142 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PGCP20142 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PGCP20142 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PGCP20142 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PGCP20142 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PGCP20142 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PGCP20142 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PGCP20142 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PGCP20142 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PGCP20142 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PGCP20142 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PGCP20142 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PGCP20142 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PGCP20142 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PGCP20142 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PGCP20142 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PGCP20142 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PGCP20142 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PGCP20142 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PGCP20142 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PGCP20142 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PGCP20142 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PGCP20142 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PGCP20142 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PGCP20142 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PGCP20142 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PGCP20142 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PGCP20142 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PGCP20142 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PGCP20142 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PGCP20142 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PGCP20142 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PGCP20142 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PGCP20142 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PGCP20142 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PGCP20142 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PGCP20142 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PGCP20142 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PGCP20142 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PGCP20142 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PGCP20142 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PGCP20142 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PGCP20142 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PGCP20142 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PGCP20142 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PGCP20142 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PGCP20142 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PGCP20142 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PGCP20142 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PGCP20142 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PGCP20142 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PGCP20142 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PGCP20142 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PGCP20142 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PGCP20142 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PGCP20142 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PGCP20142 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PGCP20142 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PGCP20142 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PGCP20142 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGCP20142 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PGCP20142 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PGCP20142 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PGCP20142 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PGCP20142 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PGCP20142 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PGCP20142 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PGCP20142 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PGCP20142 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PGCP20142 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PGCP20142 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PGCP20142 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms