Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
COLEC12Q5KU26 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
COLEC12Q5KU26 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms