Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ITGA2P17301 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.9 ms