Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ITGA2P17301 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ITGA2P17301 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ITGA2P17301 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
ITGA2P17301 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ITGA2P17301 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ITGA2P17301 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
ITGA2P17301 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGA2P17301 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGA2P17301 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ITGA2P17301 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ITGA2P17301 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ITGA2P17301 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGA2P17301 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGA2P17301 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGA2P17301 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ITGA2P17301 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ITGA2P17301 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGA2P17301 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGA2P17301 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGA2P17301 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ITGA2P17301 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ITGA2P17301 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ITGA2P17301 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGA2P17301 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGA2P17301 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGA2P17301 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGA2P17301 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGA2P17301 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ITGA2P17301 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGA2P17301 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ITGA2P17301 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ITGA2P17301 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGA2P17301 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGA2P17301 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGA2P17301 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ITGA2P17301 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ITGA2P17301 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ITGA2P17301 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ITGA2P17301 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ITGA2P17301 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGA2P17301 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA2P17301 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGA2P17301 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGA2P17301 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGA2P17301 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGA2P17301 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGA2P17301 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGA2P17301 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGA2P17301 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ITGA2P17301 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGA2P17301 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGA2P17301 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGA2P17301 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ITGA2P17301 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ITGA2P17301 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ITGA2P17301 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ITGA2P17301 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ITGA2P17301 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ITGA2P17301 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ITGA2P17301 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ITGA2P17301 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ITGA2P17301 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ITGA2P17301 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ITGA2P17301 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGA2P17301 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ITGA2P17301 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ITGA2P17301 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ITGA2P17301 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ITGA2P17301 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ITGA2P17301 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ITGA2P17301 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ITGA2P17301 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ITGA2P17301 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ITGA2P17301 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ITGA2P17301 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ITGA2P17301 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ITGA2P17301 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ITGA2P17301 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ITGA2P17301 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ITGA2P17301 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ITGA2P17301 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ITGA2P17301 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA2P17301 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ITGA2P17301 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ITGA2P17301 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGA2P17301 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ITGA2P17301 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA2P17301 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ITGA2P17301 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ITGA2P17301 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ITGA2P17301 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ITGA2P17301 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ITGA2P17301 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ITGA2P17301 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ITGA2P17301 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ITGA2P17301 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ITGA2P17301 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ITGA2P17301 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGA2P17301 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms