Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GJB4Q9NTQ9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GJB4Q9NTQ9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms