Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SND1Q7KZF4 CAPNS1-203ENST00000586963 570 ntTSL 28.3□□□□□ -1.087e-7■■□□□ 11.5
SND1Q7KZF4 CAPNS1-210ENST00000590211 403 ntTSL 56.69□□□□□ -1.347e-7■■□□□ 11.5
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SND1Q7KZF4 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.84e-13■■□□□ 11.5
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SND1Q7KZF4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.31e-7■■□□□ 11.5
SND1Q7KZF4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.281e-7■■□□□ 11.5
SND1Q7KZF4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.041e-7■■□□□ 11.5
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SND1Q7KZF4 MBNL1-207ENST00000459747 594 ntTSL 415.98■□□□□ 0.155e-7■■□□□ 11.5
SND1Q7KZF4 NUCB2-209ENST00000529313 937 ntTSL 515.71■□□□□ 0.111e-7■■□□□ 11.5
SND1Q7KZF4 NUCB2-218ENST00000533926 498 ntTSL 315.71■□□□□ 0.111e-7■■□□□ 11.5
SND1Q7KZF4 SUCLG1-202ENST00000430989 571 ntTSL 413.08□□□□□ -0.321e-10■■□□□ 11.5
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