RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542663.1

CLSTN3-214, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CLSTN3, Length 390 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-214ENST00000542663 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.48■■■■■ 4.87
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CLSTN3-214ENST00000542663 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.99■■■■□ 3.83
CLSTN3-214ENST00000542663 NACADO15069 1562 aa38.8■■■■□ 3.8
CLSTN3-214ENST00000542663 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.51■■■■□ 3.76
CLSTN3-214ENST00000542663 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.35■■■■□ 3.73
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CLSTN3-214ENST00000542663 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.16■■■■□ 3.7
CLSTN3-214ENST00000542663 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.11■■■■□ 3.69
CLSTN3-214ENST00000542663 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.64■■■■□ 3.62
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CLSTN3-214ENST00000542663 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.45■■■■□ 3.59
CLSTN3-214ENST00000542663 SCRIBQ14160 1630 aa37.34■■■■□ 3.57
CLSTN3-214ENST00000542663 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.32■■■■□ 3.57
CLSTN3-214ENST00000542663 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.18■■■■□ 3.54
CLSTN3-214ENST00000542663 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
CLSTN3-214ENST00000542663 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.98■■■■□ 3.35
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CLSTN3-214ENST00000542663 ERCC6Q03468 1493 aa35.59■■■■□ 3.29
CLSTN3-214ENST00000542663 HMGXB3Q12766 1538 aa35.55■■■■□ 3.28
CLSTN3-214ENST00000542663 SMARCA2P51531 1590 aa35.54■■■■□ 3.28
CLSTN3-214ENST00000542663 NESP48681 1621 aa35.39■■■■□ 3.26
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CLSTN3-214ENST00000542663 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.05■■■■□ 3.2
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CLSTN3-214ENST00000542663 WIZO95785 1651 aa34.69■■■■□ 3.14
CLSTN3-214ENST00000542663 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.64■■■■□ 3.14
CLSTN3-214ENST00000542663 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.57■■■■□ 3.12
CLSTN3-214ENST00000542663 WDR62O43379 1518 aa34.55■■■■□ 3.12
CLSTN3-214ENST00000542663 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.36■■■■□ 3.09
CLSTN3-214ENST00000542663 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.29■■■■□ 3.08
CLSTN3-214ENST00000542663 CFTRP13569 1480 aa34.23■■■■□ 3.07
CLSTN3-214ENST00000542663 TRIM41Q8WV44 630 aa34.23■■■■□ 3.07
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CLSTN3-214ENST00000542663 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.16■■■■□ 3.06
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CLSTN3-214ENST00000542663 OSCARQ8IYS5 282 aa33.9■■■■□ 3.02
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CLSTN3-214ENST00000542663 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.68■■■□□ 2.98
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CLSTN3-214ENST00000542663 IFT140Q96RY7 1462 aa33.67■■■□□ 2.98
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CLSTN3-214ENST00000542663 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.14■■■□□ 2.9
CLSTN3-214ENST00000542663 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.14■■■□□ 2.9
CLSTN3-214ENST00000542663 ARAP1Q96P48 1450 aa33.13■■■□□ 2.89
CLSTN3-214ENST00000542663 FBLN2P98095 1184 aa33.06■■■□□ 2.88
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CLSTN3-214ENST00000542663 WDR97A6NE52 1622 aa33.03■■■□□ 2.88
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CLSTN3-214ENST00000542663 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa32.98■■■□□ 2.87
CLSTN3-214ENST00000542663 CUX1P39880 1505 aa32.97■■■□□ 2.87
CLSTN3-214ENST00000542663 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.97■■■□□ 2.87
CLSTN3-214ENST00000542663 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP32.87■■■□□ 2.85
CLSTN3-214ENST00000542663 SYNJ1O43426 1573 aa32.87■■■□□ 2.85
CLSTN3-214ENST00000542663 PBRM1Q86U86 1689 aa32.85■■■□□ 2.85
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CLSTN3-214ENST00000542663 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.68■■■□□ 2.82
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CLSTN3-214ENST00000542663 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.61■■■□□ 2.81
CLSTN3-214ENST00000542663 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.45■■■□□ 2.78
CLSTN3-214ENST00000542663 GRIN2AQ12879 1464 aa32.43■■■□□ 2.78
CLSTN3-214ENST00000542663 ADAMTS12P58397 1594 aa32.43■■■□□ 2.78
CLSTN3-214ENST00000542663 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.42■■■□□ 2.78
CLSTN3-214ENST00000542663 CEP170Q5SW79 1584 aa32.4■■■□□ 2.78
CLSTN3-214ENST00000542663 TOP2BQ02880 1626 aa32.37■■■□□ 2.77
CLSTN3-214ENST00000542663 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.35■■■□□ 2.77
CLSTN3-214ENST00000542663 SHROOM2Q13796 1616 aa32.33■■■□□ 2.77
CLSTN3-214ENST00000542663 NUP160Q12769 1436 aa32.33■■■□□ 2.77
CLSTN3-214ENST00000542663 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
CLSTN3-214ENST00000542663 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.22■■■□□ 2.75
CLSTN3-214ENST00000542663 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.21■■■□□ 2.75
CLSTN3-214ENST00000542663 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.16■■■□□ 2.74
CLSTN3-214ENST00000542663 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.1■■■□□ 2.73
CLSTN3-214ENST00000542663 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
CLSTN3-214ENST00000542663 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32■■■□□ 2.71
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