Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SCARB2Q14108 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SCARB2Q14108 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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