Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF85Q03923 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF85Q03923 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF85Q03923 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms