Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSIP1Q8NA03 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms