Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZBED9Q6R2W3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZBED9Q6R2W3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
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