Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.245e-7■■■□□ 14.7
ILF3Q12906 UBAP2-212ENST00000629575 3460 ntTSL 27.15□□□□□ -1.265e-7■■■□□ 14.7
ILF3Q12906 ST6GAL1-207ENST00000438590 608 ntTSL 311.78□□□□□ -0.523e-6■■■□□ 14.7
ILF3Q12906 DHX15-207ENST00000511553 532 ntTSL 420.38■□□□□ 0.851e-6■■■□□ 14.7
ILF3Q12906 DHX15-210ENST00000513092 567 ntTSL 416.23■□□□□ 0.191e-6■■■□□ 14.7
ILF3Q12906 PUM1-213ENST00000524516 561 ntTSL 28.1□□□□□ -1.113e-7■■■□□ 14.7
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ILF3Q12906 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.788e-8■■■□□ 14.7
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ILF3Q12906 HECTD1-213ENST00000556224 3267 ntTSL 512.37□□□□□ -0.431e-6■■■□□ 14.7
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ILF3Q12906 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.562e-6■■■□□ 14.7
ILF3Q12906 EARS2-214ENST00000564987 2870 ntTSL 1 (best)10.34□□□□□ -0.752e-6■■■□□ 14.7
ILF3Q12906 EARS2-201ENST00000449606 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.872e-6■■■□□ 14.7
ILF3Q12906 EARS2-207ENST00000563459 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.912e-6■■■□□ 14.7
ILF3Q12906 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.518e-7■■■□□ 14.7
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ILF3Q12906 FNBP4-214ENST00000540172 582 ntTSL 314.53□□□□□ -0.082e-6■■■□□ 14.7
ILF3Q12906 LRP8-209ENST00000480045 3231 ntTSL 518.3■□□□□ 0.522e-6■■■□□ 14.7
ILF3Q12906 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.352e-6■■■□□ 14.7
ILF3Q12906 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.092e-6■■■□□ 14.7
ILF3Q12906 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.092e-6■■■□□ 14.7
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ILF3Q12906 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.352e-6■■■□□ 14.7
ILF3Q12906 TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.623e-7■■■□□ 14.7
ILF3Q12906 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.751e-6■■■□□ 14.7
ILF3Q12906 ARHGAP11B-203ENST00000563110 2043 ntTSL 1 (best)15.95■□□□□ 0.147e-9■■■□□ 14.7
ILF3Q12906 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.037e-9■■■□□ 14.7
ILF3Q12906 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.121e-10■■■□□ 14.6
ILF3Q12906 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.861e-10■■■□□ 14.6
ILF3Q12906 ZNF444-204ENST00000587236 5565 ntTSL 215.8■□□□□ 0.121e-10■■■□□ 14.6
ILF3Q12906 CCDC97-201ENST00000269967 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.411e-6■■■□□ 14.6
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ILF3Q12906 AL645922.1-201ENST00000456570 3874 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.875e-6■■■□□ 14.6
ILF3Q12906 C2-214ENST00000485690 894 ntTSL 59.28□□□□□ -0.925e-6■■■□□ 14.6
ILF3Q12906 C2-201ENST00000299367 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.035e-6■■■□□ 14.6
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ILF3Q12906 HMGXB4-202ENST00000418170 4216 ntTSL 1 (best)7.38□□□□□ -1.235e-14■■■□□ 14.6
ILF3Q12906 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.522e-6■■■□□ 14.6
ILF3Q12906 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.562e-6■■■□□ 14.6
ILF3Q12906 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.695e-6■■■□□ 14.6
ILF3Q12906 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.541e-6■■■□□ 14.6
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ILF3Q12906 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.081e-6■■■□□ 14.6
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ILF3Q12906 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.211e-6■■■□□ 14.6
ILF3Q12906 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.251e-6■■■□□ 14.6
ILF3Q12906 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.283e-7■■■□□ 14.6
ILF3Q12906 USP31-201ENST00000219689 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.654e-8■■■□□ 14.6
ILF3Q12906 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.127e-7■■■□□ 14.6
ILF3Q12906 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.127e-7■■■□□ 14.6
ILF3Q12906 HM13-205ENST00000460225 443 ntTSL 513.76□□□□□ -0.217e-7■■■□□ 14.6
ILF3Q12906 HM13-203ENST00000344042 847 ntTSL 513.67□□□□□ -0.227e-7■■■□□ 14.6
ILF3Q12906 HM13-223ENST00000496438 699 ntTSL 511.98□□□□□ -0.497e-7■■■□□ 14.6
ILF3Q12906 HM13-204ENST00000398174 3792 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.797e-7■■■□□ 14.6
ILF3Q12906 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.13e-6■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 GSK3B-202ENST00000316626 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.793e-6■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.114e-14■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.362e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.352e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 PHRF1-206ENST00000534320 5178 ntTSL 516.82■□□□□ 0.282e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.212e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.092e-7■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.851e-6■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.291e-6■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.521e-6■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.791e-6■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.81e-6■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.851e-6■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.881e-6■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.061e-6■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 GREB1-210ENST00000628795 438 ntTSL 54.5□□□□□ -1.693e-6■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.115e-12■■□□□ 14.5
ILF3Q12906 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.195e-12■■□□□ 14.5
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