Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P9

SPEF1, Sperm flagellar protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPEF1Q9Y4P9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPEF1Q9Y4P9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPEF1Q9Y4P9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPEF1Q9Y4P9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPEF1Q9Y4P9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPEF1Q9Y4P9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPEF1Q9Y4P9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPEF1Q9Y4P9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPEF1Q9Y4P9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPEF1Q9Y4P9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPEF1Q9Y4P9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPEF1Q9Y4P9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPEF1Q9Y4P9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPEF1Q9Y4P9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPEF1Q9Y4P9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPEF1Q9Y4P9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPEF1Q9Y4P9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF1Q9Y4P9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF1Q9Y4P9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF1Q9Y4P9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF1Q9Y4P9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPEF1Q9Y4P9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF1Q9Y4P9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF1Q9Y4P9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF1Q9Y4P9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPEF1Q9Y4P9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms