Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBE2J1Q9Y385 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE2J1Q9Y385 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
UBE2J1Q9Y385 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE2J1Q9Y385 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE2J1Q9Y385 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE2J1Q9Y385 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
UBE2J1Q9Y385 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
UBE2J1Q9Y385 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.5 ms