Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CGGBP1Q9UFW8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGGBP1Q9UFW8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGGBP1Q9UFW8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CGGBP1Q9UFW8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGGBP1Q9UFW8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGGBP1Q9UFW8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGGBP1Q9UFW8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGGBP1Q9UFW8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGGBP1Q9UFW8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGGBP1Q9UFW8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGGBP1Q9UFW8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGGBP1Q9UFW8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGGBP1Q9UFW8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGGBP1Q9UFW8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGGBP1Q9UFW8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGGBP1Q9UFW8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGGBP1Q9UFW8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGGBP1Q9UFW8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGGBP1Q9UFW8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGGBP1Q9UFW8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGGBP1Q9UFW8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CGGBP1Q9UFW8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CGGBP1Q9UFW8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CGGBP1Q9UFW8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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