Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR8

ING3, Inhibitor of growth protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING3Q9NXR8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ING3Q9NXR8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ING3Q9NXR8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ING3Q9NXR8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ING3Q9NXR8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms