Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDCA4Q9BXL8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDCA4Q9BXL8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDCA4Q9BXL8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA4Q9BXL8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA4Q9BXL8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCA4Q9BXL8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA4Q9BXL8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCA4Q9BXL8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA4Q9BXL8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA4Q9BXL8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA4Q9BXL8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA4Q9BXL8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA4Q9BXL8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms