Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVC6

TMEM109, Transmembrane protein 109, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM109Q9BVC6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM109Q9BVC6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM109Q9BVC6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM109Q9BVC6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMEM109Q9BVC6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM109Q9BVC6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM109Q9BVC6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM109Q9BVC6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMEM109Q9BVC6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM109Q9BVC6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM109Q9BVC6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM109Q9BVC6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMEM109Q9BVC6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM109Q9BVC6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM109Q9BVC6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM109Q9BVC6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM109Q9BVC6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM109Q9BVC6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM109Q9BVC6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM109Q9BVC6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM109Q9BVC6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM109Q9BVC6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM109Q9BVC6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM109Q9BVC6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM109Q9BVC6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM109Q9BVC6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM109Q9BVC6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM109Q9BVC6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM109Q9BVC6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM109Q9BVC6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM109Q9BVC6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM109Q9BVC6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM109Q9BVC6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM109Q9BVC6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM109Q9BVC6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM109Q9BVC6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM109Q9BVC6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM109Q9BVC6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM109Q9BVC6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM109Q9BVC6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM109Q9BVC6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM109Q9BVC6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMEM109Q9BVC6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM109Q9BVC6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM109Q9BVC6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM109Q9BVC6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM109Q9BVC6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM109Q9BVC6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM109Q9BVC6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM109Q9BVC6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM109Q9BVC6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM109Q9BVC6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM109Q9BVC6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM109Q9BVC6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM109Q9BVC6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM109Q9BVC6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM109Q9BVC6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM109Q9BVC6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM109Q9BVC6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM109Q9BVC6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM109Q9BVC6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM109Q9BVC6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM109Q9BVC6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM109Q9BVC6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM109Q9BVC6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMEM109Q9BVC6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMEM109Q9BVC6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms