Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTT6

LRRC1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1Q9BTT6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC1Q9BTT6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC1Q9BTT6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC1Q9BTT6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC1Q9BTT6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC1Q9BTT6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRRC1Q9BTT6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRRC1Q9BTT6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC1Q9BTT6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC1Q9BTT6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRC1Q9BTT6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC1Q9BTT6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC1Q9BTT6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRC1Q9BTT6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC1Q9BTT6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC1Q9BTT6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC1Q9BTT6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC1Q9BTT6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LRRC1Q9BTT6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms