Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATP5SQ99766 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATP5SQ99766 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
ATP5SQ99766 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ATP5SQ99766 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms