Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1E2Q96A05 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1E2Q96A05 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1E2Q96A05 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1E2Q96A05 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1E2Q96A05 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP6V1E2Q96A05 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1E2Q96A05 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1E2Q96A05 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1E2Q96A05 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1E2Q96A05 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1E2Q96A05 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1E2Q96A05 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1E2Q96A05 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP6V1E2Q96A05 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP6V1E2Q96A05 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP6V1E2Q96A05 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms