Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE1

CNIH3, Protein cornichon homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3Q8TBE1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CNIH3Q8TBE1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNIH3Q8TBE1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNIH3Q8TBE1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNIH3Q8TBE1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms