Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TMEM229BQ8NBD8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TMEM229BQ8NBD8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TMEM229BQ8NBD8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
TMEM229BQ8NBD8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms