Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7R0

NANOGP1, Putative homeobox protein NANOG2, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP1Q8N7R0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NANOGP1Q8N7R0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NANOGP1Q8N7R0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NANOGP1Q8N7R0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NANOGP1Q8N7R0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NANOGP1Q8N7R0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NANOGP1Q8N7R0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NANOGP1Q8N7R0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NANOGP1Q8N7R0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NANOGP1Q8N7R0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGP1Q8N7R0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGP1Q8N7R0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGP1Q8N7R0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGP1Q8N7R0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGP1Q8N7R0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGP1Q8N7R0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGP1Q8N7R0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGP1Q8N7R0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NANOGP1Q8N7R0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NANOGP1Q8N7R0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NANOGP1Q8N7R0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NANOGP1Q8N7R0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NANOGP1Q8N7R0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NANOGP1Q8N7R0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGP1Q8N7R0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGP1Q8N7R0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGP1Q8N7R0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NANOGP1Q8N7R0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms