Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPFIBP1Q86W92 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PPFIBP1Q86W92 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPFIBP1Q86W92 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIBP1Q86W92 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIBP1Q86W92 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIBP1Q86W92 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPFIBP1Q86W92 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPFIBP1Q86W92 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPFIBP1Q86W92 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPFIBP1Q86W92 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPFIBP1Q86W92 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPFIBP1Q86W92 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPFIBP1Q86W92 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPFIBP1Q86W92 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPFIBP1Q86W92 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPFIBP1Q86W92 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPFIBP1Q86W92 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPFIBP1Q86W92 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPFIBP1Q86W92 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPFIBP1Q86W92 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPFIBP1Q86W92 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPFIBP1Q86W92 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPFIBP1Q86W92 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PPFIBP1Q86W92 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PPFIBP1Q86W92 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PPFIBP1Q86W92 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPFIBP1Q86W92 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPFIBP1Q86W92 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPFIBP1Q86W92 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPFIBP1Q86W92 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPFIBP1Q86W92 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPFIBP1Q86W92 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPFIBP1Q86W92 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPFIBP1Q86W92 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPFIBP1Q86W92 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPFIBP1Q86W92 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPFIBP1Q86W92 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPFIBP1Q86W92 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPFIBP1Q86W92 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PPFIBP1Q86W92 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPFIBP1Q86W92 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPFIBP1Q86W92 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPFIBP1Q86W92 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPFIBP1Q86W92 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms