Protein–RNA interactions for Protein: Q86VW1

SLC22A16, Solute carrier family 22 member 16, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A16Q86VW1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC22A16Q86VW1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC22A16Q86VW1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC22A16Q86VW1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A16Q86VW1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A16Q86VW1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A16Q86VW1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A16Q86VW1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC22A16Q86VW1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC22A16Q86VW1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC22A16Q86VW1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC22A16Q86VW1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC22A16Q86VW1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC22A16Q86VW1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC22A16Q86VW1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC22A16Q86VW1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC22A16Q86VW1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC22A16Q86VW1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC22A16Q86VW1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC22A16Q86VW1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC22A16Q86VW1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A16Q86VW1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC22A16Q86VW1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC22A16Q86VW1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC22A16Q86VW1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC22A16Q86VW1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms