Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PACS2Q86VP3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PACS2Q86VP3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PACS2Q86VP3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PACS2Q86VP3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PACS2Q86VP3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PACS2Q86VP3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PACS2Q86VP3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PACS2Q86VP3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PACS2Q86VP3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PACS2Q86VP3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PACS2Q86VP3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PACS2Q86VP3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PACS2Q86VP3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PACS2Q86VP3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PACS2Q86VP3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PACS2Q86VP3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PACS2Q86VP3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PACS2Q86VP3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
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