Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC46A3Q7Z3Q1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC46A3Q7Z3Q1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC46A3Q7Z3Q1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC46A3Q7Z3Q1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC46A3Q7Z3Q1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC46A3Q7Z3Q1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC46A3Q7Z3Q1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC46A3Q7Z3Q1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC46A3Q7Z3Q1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC46A3Q7Z3Q1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC46A3Q7Z3Q1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC46A3Q7Z3Q1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A3Q7Z3Q1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC46A3Q7Z3Q1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A3Q7Z3Q1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A3Q7Z3Q1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A3Q7Z3Q1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC46A3Q7Z3Q1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A3Q7Z3Q1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A3Q7Z3Q1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A3Q7Z3Q1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A3Q7Z3Q1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC46A3Q7Z3Q1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC46A3Q7Z3Q1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC46A3Q7Z3Q1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC46A3Q7Z3Q1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC46A3Q7Z3Q1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC46A3Q7Z3Q1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC46A3Q7Z3Q1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC46A3Q7Z3Q1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC46A3Q7Z3Q1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms