Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SARM1Q6SZW1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SARM1Q6SZW1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SARM1Q6SZW1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SARM1Q6SZW1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SARM1Q6SZW1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SARM1Q6SZW1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SARM1Q6SZW1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SARM1Q6SZW1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SARM1Q6SZW1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SARM1Q6SZW1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SARM1Q6SZW1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SARM1Q6SZW1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SARM1Q6SZW1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SARM1Q6SZW1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SARM1Q6SZW1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SARM1Q6SZW1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SARM1Q6SZW1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SARM1Q6SZW1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SARM1Q6SZW1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SARM1Q6SZW1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SARM1Q6SZW1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms