Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT52

CGB2, Choriogonadotropin subunit beta variant 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB2Q6NT52 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGB2Q6NT52 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGB2Q6NT52 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGB2Q6NT52 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGB2Q6NT52 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGB2Q6NT52 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CGB2Q6NT52 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGB2Q6NT52 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CGB2Q6NT52 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGB2Q6NT52 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGB2Q6NT52 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGB2Q6NT52 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CGB2Q6NT52 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CGB2Q6NT52 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGB2Q6NT52 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CGB2Q6NT52 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CGB2Q6NT52 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGB2Q6NT52 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGB2Q6NT52 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGB2Q6NT52 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGB2Q6NT52 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CGB2Q6NT52 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGB2Q6NT52 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGB2Q6NT52 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CGB2Q6NT52 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CGB2Q6NT52 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGB2Q6NT52 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGB2Q6NT52 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGB2Q6NT52 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGB2Q6NT52 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CGB2Q6NT52 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGB2Q6NT52 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGB2Q6NT52 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CGB2Q6NT52 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CGB2Q6NT52 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CGB2Q6NT52 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CGB2Q6NT52 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CGB2Q6NT52 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CGB2Q6NT52 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGB2Q6NT52 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGB2Q6NT52 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGB2Q6NT52 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGB2Q6NT52 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CGB2Q6NT52 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGB2Q6NT52 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGB2Q6NT52 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGB2Q6NT52 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGB2Q6NT52 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGB2Q6NT52 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CGB2Q6NT52 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGB2Q6NT52 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGB2Q6NT52 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGB2Q6NT52 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGB2Q6NT52 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CGB2Q6NT52 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CGB2Q6NT52 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGB2Q6NT52 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGB2Q6NT52 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGB2Q6NT52 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGB2Q6NT52 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CGB2Q6NT52 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CGB2Q6NT52 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms