Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FAM208BQ5VWN6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
FAM208BQ5VWN6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
FAM208BQ5VWN6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FAM208BQ5VWN6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM208BQ5VWN6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM208BQ5VWN6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM208BQ5VWN6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM208BQ5VWN6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FAM208BQ5VWN6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM208BQ5VWN6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM208BQ5VWN6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FAM208BQ5VWN6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM208BQ5VWN6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM208BQ5VWN6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FAM208BQ5VWN6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FAM208BQ5VWN6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM208BQ5VWN6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM208BQ5VWN6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FAM208BQ5VWN6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
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