Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CROCCQ5TZA2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CROCCQ5TZA2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CROCCQ5TZA2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CROCCQ5TZA2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CROCCQ5TZA2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CROCCQ5TZA2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CROCCQ5TZA2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CROCCQ5TZA2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CROCCQ5TZA2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CROCCQ5TZA2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CROCCQ5TZA2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CROCCQ5TZA2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CROCCQ5TZA2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CROCCQ5TZA2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CROCCQ5TZA2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CROCCQ5TZA2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CROCCQ5TZA2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CROCCQ5TZA2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CROCCQ5TZA2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CROCCQ5TZA2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CROCCQ5TZA2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CROCCQ5TZA2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CROCCQ5TZA2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CROCCQ5TZA2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CROCCQ5TZA2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CROCCQ5TZA2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CROCCQ5TZA2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CROCCQ5TZA2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms