Protein–RNA interactions for Protein: Q5TZA2

CROCC, Rootletin, humanhuman

Predictions only

Length 2,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCCQ5TZA2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CROCCQ5TZA2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CROCCQ5TZA2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CROCCQ5TZA2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
CROCCQ5TZA2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CROCCQ5TZA2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CROCCQ5TZA2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CROCCQ5TZA2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CROCCQ5TZA2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CROCCQ5TZA2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CROCCQ5TZA2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CROCCQ5TZA2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CROCCQ5TZA2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CROCCQ5TZA2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CROCCQ5TZA2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CROCCQ5TZA2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CROCCQ5TZA2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
CROCCQ5TZA2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CROCCQ5TZA2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CROCCQ5TZA2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CROCCQ5TZA2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CROCCQ5TZA2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CROCCQ5TZA2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CROCCQ5TZA2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CROCCQ5TZA2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CROCCQ5TZA2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CROCCQ5TZA2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CROCCQ5TZA2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CROCCQ5TZA2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CROCCQ5TZA2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CROCCQ5TZA2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CROCCQ5TZA2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CROCCQ5TZA2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CROCCQ5TZA2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CROCCQ5TZA2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CROCCQ5TZA2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CROCCQ5TZA2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CROCCQ5TZA2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CROCCQ5TZA2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CROCCQ5TZA2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CROCCQ5TZA2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CROCCQ5TZA2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CROCCQ5TZA2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CROCCQ5TZA2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CROCCQ5TZA2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CROCCQ5TZA2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CROCCQ5TZA2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CROCCQ5TZA2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CROCCQ5TZA2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CROCCQ5TZA2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CROCCQ5TZA2 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CROCCQ5TZA2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CROCCQ5TZA2 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CROCCQ5TZA2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CROCCQ5TZA2 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CROCCQ5TZA2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CROCCQ5TZA2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CROCCQ5TZA2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CROCCQ5TZA2 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CROCCQ5TZA2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CROCCQ5TZA2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CROCCQ5TZA2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CROCCQ5TZA2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CROCCQ5TZA2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CROCCQ5TZA2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CROCCQ5TZA2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CROCCQ5TZA2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CROCCQ5TZA2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CROCCQ5TZA2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CROCCQ5TZA2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CROCCQ5TZA2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CROCCQ5TZA2 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CROCCQ5TZA2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CROCCQ5TZA2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CROCCQ5TZA2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CROCCQ5TZA2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CROCCQ5TZA2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CROCCQ5TZA2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
CROCCQ5TZA2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CROCCQ5TZA2 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CROCCQ5TZA2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CROCCQ5TZA2 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CROCCQ5TZA2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CROCCQ5TZA2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CROCCQ5TZA2 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CROCCQ5TZA2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CROCCQ5TZA2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CROCCQ5TZA2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CROCCQ5TZA2 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CROCCQ5TZA2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CROCCQ5TZA2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CROCCQ5TZA2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CROCCQ5TZA2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CROCCQ5TZA2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CROCCQ5TZA2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CROCCQ5TZA2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CROCCQ5TZA2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CROCCQ5TZA2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCCQ5TZA2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CROCCQ5TZA2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms