Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9K5

ZMAT1, Zinc finger matrin-type protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMAT1Q5H9K5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZMAT1Q5H9K5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZMAT1Q5H9K5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZMAT1Q5H9K5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZMAT1Q5H9K5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZMAT1Q5H9K5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZMAT1Q5H9K5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZMAT1Q5H9K5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZMAT1Q5H9K5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZMAT1Q5H9K5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZMAT1Q5H9K5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZMAT1Q5H9K5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZMAT1Q5H9K5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZMAT1Q5H9K5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZMAT1Q5H9K5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZMAT1Q5H9K5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZMAT1Q5H9K5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZMAT1Q5H9K5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZMAT1Q5H9K5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZMAT1Q5H9K5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZMAT1Q5H9K5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZMAT1Q5H9K5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZMAT1Q5H9K5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZMAT1Q5H9K5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZMAT1Q5H9K5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZMAT1Q5H9K5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZMAT1Q5H9K5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZMAT1Q5H9K5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZMAT1Q5H9K5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZMAT1Q5H9K5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZMAT1Q5H9K5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZMAT1Q5H9K5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZMAT1Q5H9K5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZMAT1Q5H9K5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZMAT1Q5H9K5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms