Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9K5

ZMAT1, Zinc finger matrin-type protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMAT1Q5H9K5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZMAT1Q5H9K5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZMAT1Q5H9K5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ZMAT1Q5H9K5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZMAT1Q5H9K5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZMAT1Q5H9K5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ZMAT1Q5H9K5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ZMAT1Q5H9K5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ZMAT1Q5H9K5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ZMAT1Q5H9K5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZMAT1Q5H9K5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZMAT1Q5H9K5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ZMAT1Q5H9K5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ZMAT1Q5H9K5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ZMAT1Q5H9K5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZMAT1Q5H9K5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZMAT1Q5H9K5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZMAT1Q5H9K5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZMAT1Q5H9K5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZMAT1Q5H9K5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZMAT1Q5H9K5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZMAT1Q5H9K5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ZMAT1Q5H9K5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ZMAT1Q5H9K5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ZMAT1Q5H9K5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
ZMAT1Q5H9K5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZMAT1Q5H9K5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZMAT1Q5H9K5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ZMAT1Q5H9K5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZMAT1Q5H9K5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ZMAT1Q5H9K5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ZMAT1Q5H9K5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ZMAT1Q5H9K5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZMAT1Q5H9K5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZMAT1Q5H9K5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZMAT1Q5H9K5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZMAT1Q5H9K5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZMAT1Q5H9K5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZMAT1Q5H9K5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZMAT1Q5H9K5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZMAT1Q5H9K5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZMAT1Q5H9K5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZMAT1Q5H9K5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZMAT1Q5H9K5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZMAT1Q5H9K5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZMAT1Q5H9K5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZMAT1Q5H9K5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZMAT1Q5H9K5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZMAT1Q5H9K5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZMAT1Q5H9K5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZMAT1Q5H9K5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZMAT1Q5H9K5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZMAT1Q5H9K5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZMAT1Q5H9K5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZMAT1Q5H9K5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZMAT1Q5H9K5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZMAT1Q5H9K5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ZMAT1Q5H9K5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZMAT1Q5H9K5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZMAT1Q5H9K5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZMAT1Q5H9K5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZMAT1Q5H9K5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZMAT1Q5H9K5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZMAT1Q5H9K5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZMAT1Q5H9K5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZMAT1Q5H9K5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZMAT1Q5H9K5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZMAT1Q5H9K5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZMAT1Q5H9K5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZMAT1Q5H9K5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZMAT1Q5H9K5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZMAT1Q5H9K5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZMAT1Q5H9K5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZMAT1Q5H9K5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZMAT1Q5H9K5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ZMAT1Q5H9K5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZMAT1Q5H9K5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ZMAT1Q5H9K5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZMAT1Q5H9K5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZMAT1Q5H9K5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZMAT1Q5H9K5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ZMAT1Q5H9K5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ZMAT1Q5H9K5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ZMAT1Q5H9K5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ZMAT1Q5H9K5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZMAT1Q5H9K5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ZMAT1Q5H9K5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ZMAT1Q5H9K5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ZMAT1Q5H9K5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZMAT1Q5H9K5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ZMAT1Q5H9K5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZMAT1Q5H9K5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZMAT1Q5H9K5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZMAT1Q5H9K5 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZMAT1Q5H9K5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZMAT1Q5H9K5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZMAT1Q5H9K5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZMAT1Q5H9K5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZMAT1Q5H9K5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZMAT1Q5H9K5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms