Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SKOR2Q2VWA4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SKOR2Q2VWA4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SKOR2Q2VWA4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SKOR2Q2VWA4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SKOR2Q2VWA4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SKOR2Q2VWA4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SKOR2Q2VWA4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SKOR2Q2VWA4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SKOR2Q2VWA4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SKOR2Q2VWA4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SKOR2Q2VWA4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SKOR2Q2VWA4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SKOR2Q2VWA4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SKOR2Q2VWA4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SKOR2Q2VWA4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SKOR2Q2VWA4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SKOR2Q2VWA4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SKOR2Q2VWA4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SKOR2Q2VWA4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SKOR2Q2VWA4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SKOR2Q2VWA4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SKOR2Q2VWA4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SKOR2Q2VWA4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SKOR2Q2VWA4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SKOR2Q2VWA4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SKOR2Q2VWA4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SKOR2Q2VWA4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SKOR2Q2VWA4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SKOR2Q2VWA4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SKOR2Q2VWA4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SKOR2Q2VWA4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SKOR2Q2VWA4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SKOR2Q2VWA4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SKOR2Q2VWA4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SKOR2Q2VWA4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SKOR2Q2VWA4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SKOR2Q2VWA4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SKOR2Q2VWA4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SKOR2Q2VWA4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SKOR2Q2VWA4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SKOR2Q2VWA4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SKOR2Q2VWA4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SKOR2Q2VWA4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SKOR2Q2VWA4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SKOR2Q2VWA4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SKOR2Q2VWA4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SKOR2Q2VWA4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SKOR2Q2VWA4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SKOR2Q2VWA4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SKOR2Q2VWA4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SKOR2Q2VWA4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SKOR2Q2VWA4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SKOR2Q2VWA4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SKOR2Q2VWA4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms