Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRD3Q15059 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRD3Q15059 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRD3Q15059 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRD3Q15059 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRD3Q15059 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BRD3Q15059 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD3Q15059 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD3Q15059 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD3Q15059 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD3Q15059 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD3Q15059 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BRD3Q15059 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
BRD3Q15059 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRD3Q15059 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD3Q15059 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRD3Q15059 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD3Q15059 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRD3Q15059 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRD3Q15059 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRD3Q15059 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRD3Q15059 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRD3Q15059 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRD3Q15059 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRD3Q15059 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRD3Q15059 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRD3Q15059 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRD3Q15059 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRD3Q15059 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRD3Q15059 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRD3Q15059 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRD3Q15059 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
BRD3Q15059 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRD3Q15059 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRD3Q15059 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRD3Q15059 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRD3Q15059 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRD3Q15059 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRD3Q15059 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRD3Q15059 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRD3Q15059 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRD3Q15059 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRD3Q15059 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRD3Q15059 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRD3Q15059 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRD3Q15059 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRD3Q15059 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRD3Q15059 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
BRD3Q15059 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRD3Q15059 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRD3Q15059 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
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