Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IRF3Q14653 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IRF3Q14653 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IRF3Q14653 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF3Q14653 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF3Q14653 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
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