Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RBM39Q14498 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBM39Q14498 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBM39Q14498 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RBM39Q14498 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RBM39Q14498 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBM39Q14498 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBM39Q14498 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RBM39Q14498 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
RBM39Q14498 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RBM39Q14498 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RBM39Q14498 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBM39Q14498 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBM39Q14498 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RBM39Q14498 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBM39Q14498 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBM39Q14498 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RBM39Q14498 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBM39Q14498 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RBM39Q14498 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RBM39Q14498 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBM39Q14498 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RBM39Q14498 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RBM39Q14498 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RBM39Q14498 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RBM39Q14498 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RBM39Q14498 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBM39Q14498 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RBM39Q14498 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RBM39Q14498 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBM39Q14498 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RBM39Q14498 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBM39Q14498 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RBM39Q14498 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBM39Q14498 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBM39Q14498 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RBM39Q14498 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.27■■□□□ 1
RBM39Q14498 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RBM39Q14498 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RBM39Q14498 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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