Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM25Q14258 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM25Q14258 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM25Q14258 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM25Q14258 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM25Q14258 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM25Q14258 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM25Q14258 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM25Q14258 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM25Q14258 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM25Q14258 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM25Q14258 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM25Q14258 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM25Q14258 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM25Q14258 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM25Q14258 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM25Q14258 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM25Q14258 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM25Q14258 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM25Q14258 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM25Q14258 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM25Q14258 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM25Q14258 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM25Q14258 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM25Q14258 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM25Q14258 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
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