Protein–RNA interactions for Protein: Q13641

TPBG, Trophoblast glycoprotein, humanhuman

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGQ13641 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TPBGQ13641 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPBGQ13641 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPBGQ13641 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPBGQ13641 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPBGQ13641 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TPBGQ13641 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPBGQ13641 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPBGQ13641 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPBGQ13641 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPBGQ13641 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TPBGQ13641 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPBGQ13641 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPBGQ13641 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPBGQ13641 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TPBGQ13641 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPBGQ13641 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPBGQ13641 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPBGQ13641 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TPBGQ13641 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TPBGQ13641 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPBGQ13641 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPBGQ13641 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPBGQ13641 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TPBGQ13641 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TPBGQ13641 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPBGQ13641 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
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